Судя по информации, которую вы предоставляете, это решение, которое вы используете.Как правило, вы не сможете установить системное программное обеспечение на учетную запись общего хостинга.Я сомневаюсь, что Go Daddy установит это для вас.
Вам потребуется использовать решение для хостинга, которое включает это программное обеспечение, или, скорее, использовать VPS (виртуальный частный сервер) или выделенный сервер.Тогда у вас будет root-доступ и вы сможете установить любое программное обеспечение, которое вам нравится.Неуправляемые VPS не дороги, но вы должны позаботиться о резервном копировании и обновлении программного обеспечения.Если вы не хотите управлять своим сервером, то, возможно, найдете решение для хостинга, которое включает в себя расширение PHP и необходимое вам программное обеспечение.
На странице, на которую вы ссылаетесь, не содержится подробной информации о PHP (phpinfo).С помощью этой информации можно определить, можете ли вы делать то, что пытаетесь делать без xpdf.Существует также pdf2text, IIRC.