Я думаю, было бы слишком много хлопот, чтобы это произошло. Мой совет - выбрать правила fx cop, с которыми вы можете жить, и извлечь все ошибки / предупреждения из вашего кода. Таким образом, если другой член команды что-то изменит, вы заметите это, если они не пишут код, который проходит. в этом случае нет проблем.
Если вы не работаете над каким-то грандиозным проектом, для проверки которого у fxcop требуются годы, я думаю, что все должно быть в порядке, и нет причины проверять только постепенные изменения.
Если вы находитесь в ситуации, когда проект стал настолько большим, что для его анализа требуются годы, подумайте о рефакторинге. В контексте Visual Studio, где бы у вас ни были папки в проекте, рассмотрите возможность превращения их в новые проекты. Это поможет с разделением вашего кода и позволит проанализировать части всего решения, а не всего решения и всех его проектов, большинство из которых не будет иметь изменений.
Рефакторинг часто будет быстрее, с меньшими затратами на обучение, чем создание действительно индивидуальной настройки тестирования, чтобы компенсировать сложный сценарий.