Вы не можете сделать это с помощью импорта. Вы можете использовать трансфертекст, чтобы связать данные в виде таблицы, а затем запустить обновление и запрос на добавление.
sSQL="UPDATE table3 INNER JOIN MyLinkedTable " _
& "ON table3.ID=MyLinkedTable.ID " _
& "SET table3.SomeField=MyLinkedTable.SomeField "
CurrentDB.Execute sSQL, dbFailOnError
sSQL="INSERT INTO table3 (ID,SomeField ) " _
="SELECT ID, SomeField FROM MyLinkedTable " _
& "LEFT JOIN table3 " _
& "ON table3.ID=MyLinkedTable.ID " _
& "WHERE table3.ID Is Null "
CurrentDB.Execute sSQL, dbFailOnError