Невозможно объединить двоичные файлы iPad и iPhone вместе. Если вы хотите собрать их вместе, вам нужно будет создать универсальное приложение . Во время выполнения у вас будут проверки, которые определят, работает ли ваше приложение на iPad или iPhone, и определят, какой набор ViewControllers будет отображать ваше приложение.
Существует много информации о создании универсальных приложений.