Взаимодействие между iframe и родительским фреймом может быть сложным (если не невозможно, если iframe содержит контент с другого сайта / домена). В зависимости от ситуации лучше использовать вариант DIV, заполненный контентом (либо напрямую через PHP, либо с помощью функции jQuery $.load()
).
Тогда перетаскиваемый объект и его цель находятся на одной странице - намного проще.