SharePoint 2007 имеет собственную поисковую базу данных для хранения таких элементов, как области поиска и другие вещи.
Фактический поисковый индекс не использует полнотекстовый поиск, но сохраняет его информацию в файловом индексе.
Таким образом, любые поисковые запросы, выполняемые в SharePoint, не вызовут проблемы.
Поисковое сканирование сайта - это еще одна история, в реализации которой я не совсем уверен. Однако большинство сайтов SharePoint не подвержены той же транзакционной пропускной способности, что и такой сайт, как StackOverflow.
Еще больше, если сайт SharePoint использовался для размещения данных, таких как транзакционный, как StackOverflow, это может привести к очень серьезным проблемам с производительностью.
Таким образом, поиск в SharePoint 2007 не будет иметь такой же проблемы, как StackOverflow.
Я бы не стал полностью исключать некоторые скачки производительности, когда обход контента выполняется с помощью серверной части SQL 2008, но с приличным планированием и базами данных объемом менее 100 гигов эта проблема не должна быть замечена пользователями.