Да, в Mac OS X есть программа под названием Jar Bundler , которая устанавливается при установке бесплатной версии (при условии, что у вас уже есть копия Mac OS X) Xcode Developer Tools , который позволяет вам связать файл JAR внутри собственного пакета приложений Mac OS X «* .app» с красивым и блестящим значком, как и другие приложения.
Обновление
Пакет JAR не существует в более поздних версиях OS X. В качестве обходного пути вы можете вручную создать проект OS X, который вызывает Java. Или существует множество расширений системы сборки, которые делают похожую вещь; например, плагин gradle-macappbundle для Gradle создаст такое приложение-обертку.