Хотите ли вы отобразить ваши основные объекты данных на объекты хранилища данных GAE? Если это так, это может быть сложно. Как вы говорите, вам придется реализовать серверную логику с помощью Python или Java, а ваши объекты iPhone находятся в Objective-C. Вам потребуется какая-то схема для их сериализации / десериализации.
Более простой подход, если все, что вам нужно для GAE - это резервное копирование, состоит в том, чтобы сериализовать объекты данных Core и сохранять их как двоичные объекты с парами ключ-значение в GAE.
Мне не известны подобные подходы, поэтому я буду следить за этим сообщением.