Приложение .net CF 2.0 не понимает прокси WCF. Таким образом, его необходимо сначала преобразовать в прокси ASMX, а затем добавить в качестве ссылки на приложение .net CF 2.0. Но это в теории. Нужно знать точные шаги, как это сделать.
Вот хорошая статья о том, как сделать это с помощью netcfsvcutil.exe.
http://www.codeproject.com/KB/WCF/netcfwcf.aspx
В вашем проекте .net CF 2.0 вы сможете добавить ссылку на WSDL для службы на основе WCF.После этого проект должен создать .net CF 2.0-совместимый прокси.