Если ваша цель - предоставить файл для загрузки, вы можете посмотреть, как разместить этот файл в учетной записи хранения в хранилище больших двоичных объектов. Затем вы могли бы использовать CDN, чтобы обеспечить лучшую производительность для ваших конечных пользователей в их опыте загрузки.
Что касается устранения существующей проблемы, вот несколько идей ...
Вероятно, вам нужно только установить действие сборки для "Содержимое". Это должно помочь добиться того, что ваш файл будет включен при публикации вашего веб-приложения.
Чтобы убедиться в этом, щелкните правой кнопкой мыши проект веб-приложения в обозревателе решений и опубликуйте его в файловой системе. Затем вы можете проверить его, чтобы убедиться, что ваши файлы подготовлены соответствующим образом.
Вы даже можете использовать новые возможности Remote Desktop в 1.3 SDK для удаленного доступа к экземпляру веб-роли в облаке и проверки того, как был развернут ваш пакет.