Хорошо иметь много индексов, даже несколько индексов в одной таблице, , пока вы их используете .
Запустите EXPLAIN для ваших запросов и проверьте, какие индексы используются.Если есть индексы, которые не используются никакими запросами, то они не дают вам никакой пользы и просто замедляют изменения в таблице.Эти неиспользуемые индексы следует удалить.
Возможно, вы также захотите рассмотреть индексы с несколькими столбцами, если вы еще этого не сделали.