Нет, они не будут, это два совершенно разных ресурса.
Если вы не пытаетесь сделать замену соединения MySQL с подключением MySQLIi, вам не нужно беспокоиться об этом, если только вы не терпите каждый раз писать i
P
Помните, что вы все равно можете подключаться к более новым базам данных MySQL с помощью команд mysql_*
.