В X нет «системного хука», только программы, которые запускались раньше вашей и уже взяли ключ (в данном случае, вероятно, оконный менеджер). Если это только для вашего использования, измените конфигурацию другой программы. Если это программа, которую вы делаете для других, вам все равно нужно настроить ключи, так как вы никогда не знаете, какие ключи пользователи
уже назначены для использования другими приложениями, и они с большей вероятностью откажутся от вашего приложения, если вы попытаетесь навязать им свои сочетания клавиш.