Я думаю, что если наборы изменений, относящиеся к файлам в этом каталоге, относятся ТОЛЬКО к файлам в этом каталоге, вы можете использовать hg export / import для достижения этого.Сначала определите все наборы изменений для этих файлов, затем экспортируйте их, затем импортируйте их ... вот сценарий оболочки для выполнения первой части:
for i in $(hg log -M --template="{node}\n" directory)
do
hg export -r $i -o "$(date '+%Y%m%d%H%M%S')_%H"
done
, затем переместите эти файлы в новое хранилище и выполните импорт hg накаждый из них по очереди.
Если в ваших наборах изменений нет других файлов, это сработает ... даже тогда вы можете найти множество отклонений, и в него не входят исходные сообщения о фиксации или наборы изменений слияния(очевидно).