Если вы не указываете столбцы, вы должны держать записи в порядке. Например:
INSERT INTO `users` (`ID`, `Email`, `UserName`) VALUES
(1, 'so@so.com', 'StackOverflow')
будет работать, но
INSERT INTO `users` VALUES
('so@so.com', 'StackOverflow')
поместит Email в столбец идентификатора, так что это бесполезно.
Попробуйте написать столбцы как:
INSERT INTO `users` (`Email`, `UserName`) VALUES
('so@so.com', 'StackOverflow'),
('so2@so.com', 'StackOverflow2'),
('so3@so.com', 'StackOverflow3'),
etc...
Я думаю, что есть ограничение на количество строк, которые можно вставить с помощью этого метода.