Вы должны написать настраиваемое действие, чтобы либо отправить EXE-сообщение изящно завершить работу, либо вы должны написать настраиваемое действие, чтобы завершить процесс. (Менее идеальный, в зависимости от того, что делает программа, и вы будете получать надоедливую призрачную иконку в трее, пока не наведете на нее курсор.)
То, как вы это сделаете, зависит от того, по какому пути вы идете и какой язык вы хотите использовать для написания настраиваемого действия. C ++ / C # dll, InstallScript CA, VBScript CA или даже EXE CA.