Лучший способ перетасовать два массива в унисон - PullRequest
192 голосов
/ 05 января 2011

У меня есть два массива разной формы, но одинаковой длины (начальный размер). Я хочу перетасовать каждый из них так, чтобы соответствующие элементы продолжали соответствовать - т.е. перетасовывать их в унисон по отношению к их ведущим индексам.

Этот код работает и иллюстрирует мои цели:

def shuffle_in_unison(a, b):
    assert len(a) == len(b)
    shuffled_a = numpy.empty(a.shape, dtype=a.dtype)
    shuffled_b = numpy.empty(b.shape, dtype=b.dtype)
    permutation = numpy.random.permutation(len(a))
    for old_index, new_index in enumerate(permutation):
        shuffled_a[new_index] = a[old_index]
        shuffled_b[new_index] = b[old_index]
    return shuffled_a, shuffled_b

Например:

>>> a = numpy.asarray([[1, 1], [2, 2], [3, 3]])
>>> b = numpy.asarray([1, 2, 3])
>>> shuffle_in_unison(a, b)
(array([[2, 2],
       [1, 1],
       [3, 3]]), array([2, 1, 3]))

Однако это кажется неуклюжим, неэффективным и медленным, и требует создания копии массивов - я бы предпочел перетасовать их на месте, поскольку они будут довольно большими.

Есть ли лучший способ сделать это? Мои основные цели - более быстрое выполнение и меньшее использование памяти, но элегантный код тоже подойдет.

Еще одна мысль, которая у меня была:

def shuffle_in_unison_scary(a, b):
    rng_state = numpy.random.get_state()
    numpy.random.shuffle(a)
    numpy.random.set_state(rng_state)
    numpy.random.shuffle(b)

Это работает ... но это немного страшно, так как я вижу мало гарантий, что оно продолжит работать - это не похоже на то, что гарантированно выживет, например, в простой версии.

Ответы [ 14 ]

279 голосов
/ 05 января 2011

Вы можете использовать индексирование массива NumPy :

def unison_shuffled_copies(a, b):
    assert len(a) == len(b)
    p = numpy.random.permutation(len(a))
    return a[p], b[p]

Это приведет к созданию отдельных массивов в случайном порядке.

142 голосов
/ 04 июня 2015
X = np.array([[1., 0.], [2., 1.], [0., 0.]])
y = np.array([0, 1, 2])
from sklearn.utils import shuffle
X, y = shuffle(X, y, random_state=0)

Чтобы узнать больше, см. http://scikit -learn.org / stable / modules / generate / sklearn.utils.shuffle.html

61 голосов
/ 05 января 2011

Ваше "страшное" решение не кажется мне пугающим.Вызов shuffle() для двух последовательностей одинаковой длины приводит к одинаковому количеству вызовов к генератору случайных чисел, и это единственные «случайные» элементы в алгоритме случайного перемешивания.Сбрасывая состояние, вы гарантируете, что вызовы генератора случайных чисел дадут одинаковые результаты при втором вызове shuffle(), поэтому весь алгоритм будет генерировать одну и ту же перестановку.

Если вы этого не сделаететаким образом, другое решение будет хранить ваши данные в одном массиве вместо двух с самого начала и создавать два представления в этом едином массиве, имитируя два имеющихся у вас массива.Вы можете использовать один массив для перетасовки и представления для всех других целей.

Пример: предположим, что массивы a и b выглядят так:

a = numpy.array([[[  0.,   1.,   2.],
                  [  3.,   4.,   5.]],

                 [[  6.,   7.,   8.],
                  [  9.,  10.,  11.]],

                 [[ 12.,  13.,  14.],
                  [ 15.,  16.,  17.]]])

b = numpy.array([[ 0.,  1.],
                 [ 2.,  3.],
                 [ 4.,  5.]])

Мы можемТеперь создайте один массив, содержащий все данные:

c = numpy.c_[a.reshape(len(a), -1), b.reshape(len(b), -1)]
# array([[  0.,   1.,   2.,   3.,   4.,   5.,   0.,   1.],
#        [  6.,   7.,   8.,   9.,  10.,  11.,   2.,   3.],
#        [ 12.,  13.,  14.,  15.,  16.,  17.,   4.,   5.]])

Теперь мы создадим представления, имитирующие исходные a и b:

a2 = c[:, :a.size//len(a)].reshape(a.shape)
b2 = c[:, a.size//len(a):].reshape(b.shape)

Данные a2 иb2 используется совместно с c.Чтобы перетасовать оба массива одновременно, используйте numpy.random.shuffle(c).

. В рабочем коде вы, конечно, постараетесь вообще не создавать оригинальные a и b и сразу же создайте c, * 1029.* и b2.

Это решение может быть адаптировано к случаю, когда a и b имеют разные dtypes.

27 голосов
/ 08 июня 2016

Очень простое решение:

randomize = np.arange(len(x))
np.random.shuffle(randomize)
x = x[randomize]
y = y[randomize]

два массива x, y теперь оба случайно перемешаны одинаково

14 голосов
/ 30 мая 2018

Джеймс написал в 2015 году sklearn решение , что полезно. Но он добавил случайную переменную состояния, которая не нужна. В приведенном ниже коде случайное состояние из numpy принимается автоматически.

X = np.array([[1., 0.], [2., 1.], [0., 0.]])
y = np.array([0, 1, 2])
from sklearn.utils import shuffle
X, y = shuffle(X, y)
9 голосов
/ 25 июля 2018

Перемешайте любое количество массивов на месте, используя только NumPy.

import numpy as np


def shuffle_arrays(arrays, set_seed=-1):
    """Shuffles arrays in-place, in the same order, along axis=0

    Parameters:
    -----------
    arrays : List of NumPy arrays.
    set_seed : Seed value if int >= 0, else seed is random.
    """
    assert all(len(arr) == len(arrays[0]) for arr in arrays)
    seed = np.random.randint(0, 2**(32 - 1) - 1) if set_seed < 0 else set_seed

    for arr in arrays:
        rstate = np.random.RandomState(seed)
        rstate.shuffle(arr)

И можете использовать вот так

a = np.array([1, 2, 3, 4, 5])
b = np.array([10,20,30,40,50])
c = np.array([[1,10,11], [2,20,22], [3,30,33], [4,40,44], [5,50,55]])

shuffle_arrays([a, b, c])

Несколько замечаний:

  • Утверждение гарантирует, что все входные массивы будут иметь одинаковую длину вдоль их первого измерения.
  • Массивы перетасовываются на месте своим первым измерением - ничего не возвращается.
  • Случайное начальное числов пределах положительного диапазона int32.
  • Если требуется повторяющееся перемешивание, можно установить начальное значение.

После перемешивания данные можно разделить с помощью np.split или ссылаться на срезы- в зависимости от применения.

7 голосов
/ 01 апреля 2018

вы можете создать массив вроде:

s = np.arange(0, len(a), 1)

и затем перемешать его:

np.random.shuffle(s)

теперь используйте этот s в качестве аргумента ваших массивов.одни и те же перемешанные аргументы возвращают одинаковые перемешанные векторы.

x_data = x_data[s]
x_label = x_label[s]
5 голосов
/ 26 марта 2019
from np.random import permutation
from sklearn.datasets import load_iris
iris = load_iris()
X = iris.data #numpy array
y = iris.target #numpy array

# Data is currently unshuffled; we should shuffle 
# each X[i] with its corresponding y[i]
perm = permutation(len(X))
X = X[perm]
y = y[perm]
3 голосов
/ 07 ноября 2018

Существует хорошо известная функция, которая может справиться с этим:

from sklearn.model_selection import train_test_split
X, _, Y, _ = train_test_split(X,Y, test_size=0.0)

Просто установив test_size в 0, вы избежите разбиения и получите перемешанные данные.Хотя обычно он используется для разделения данных поезда и теста, он также перетасовывает их.
Из документации

Разделение массивов или матриц на случайные подмножества поезда и теста

Быстрая утилита, которая упаковывает проверку ввода и затем (ShuffleSplit (). Split (X, y)) и приложение для ввода данных в один вызов для разделения (и, возможно, подвыборки) данных в oneliner.

3 голосов
/ 01 декабря 2017

Один из способов перетасовки на месте для связанных списков - это использование начального числа (оно может быть случайным) и использование numpy.random.shuffle для выполнения перетасовки.

# Set seed to a random number if you want the shuffling to be non-deterministic.
def shuffle(a, b, seed):
   np.random.seed(seed)
   np.random.shuffle(a)
   np.random.seed(seed)
   np.random.shuffle(b)

Вот и все,Это перетасует и a, и b точно таким же образом.Это также делается на месте, что всегда является плюсом.

EDIT, не используйте np.random.seed (), используйте вместо него np.random.RandomState

def shuffle(a, b, seed):
   rand_state = np.random.RandomState(seed)
   rand_state.shuffle(a)
   rand_state.seed(seed)
   rand_state.shuffle(b)

При вызовеон просто передается в любое начальное число для подачи случайного состояния:

a = [1,2,3,4]
b = [11, 22, 33, 44]
shuffle(a, b, 12345)

Вывод:

>>> a
[1, 4, 2, 3]
>>> b
[11, 44, 22, 33]

Редактировать: Исправлен код для повторного заполнения случайного состояния

...