У меня была та же проблема, которая, кажется, была связана с проблемой конфигурации. Приложение github mac osx создало закрытый ssh-ключ с именем github_rsa
В вашем Затмении перейдите к Window > Preferences > Network Connections > SSH2
В общей вкладке вы должны увидеть SSH2 home /Users/<you username>/.ssh
вы, вероятно, увидите id_dsa, id_rsa, определенные как закрытые ключи
Нажмите «Добавить закрытый ключ» и выберите github_rsa, расположенный /Users/<you username>/.ssh