В соответствии с инструкцией MySql Query Browser я не смог найти никаких функций импорта. Только экспериментальный инструмент для импорта текста Regex.
Вы пробовали MySQL Workbench?
http://dev.mysql.com/downloads/workbench/5.2.html
Он заменяет старый MySQL Query Browser.
Из руководства по Query Browser:
Вы можете экспортировать любой набор результатов из
MySQL Query Browser, щелкнув правой кнопкой мыши
в наборе результатов и выбора
опция из РЕЗУЛЬТАТОВ ЭКСПОРТА
подменю. Вы можете выбрать для экспорта
набор результатов в CSV, XML, HTML,
Форматы Microsoft Excel XLS или PLIST.
Если вам нужно работать с MySQL Query Browser, вы можете подумать об экспорте в CSV и преобразовании его в файл .sql, используя, например, онлайн-инструмент:
http://www.withdata.com/csv/csv-to-sql/