Вы имеете в виду, что сам файл хранится в базе данных как двоичный объект? Если это так, то это похоже на тег embed, который ссылается на него, вероятно, потребуется ссылаться на промежуточную страницу, и эта страница будет тем, что возвращает SWF.
Это было сделано много раз с изображениями, и хотя я никогда не слышал, чтобы это было сделано с помощью SWF, принцип по сути тот же. Посмотрите здесь:
http://www.4guysfromrolla.com/webtech/060100-1.shtml
Это старый пример, но он должен достаточно хорошо иллюстрировать принцип. Промежуточная страница получит двоичный файл из базы данных и ответит пользовательским заголовком и потоком этих двоичных данных. С точки зрения браузера возвращаемый файл ASPX является SWF-файлом.