В Eclipse в разделе «Предупреждения и ошибки» вы можете установить для «Ненужные операции приведения или instanceof» значение «Предупредить» или «Ошибка», а не «Игнорировать». Это должно помочь вам найти их очень быстро, хотя это не очистит их для вас.
Но вы можете также установить действие «Сохранить», настроенное с «Дополнительным действием» «Удалить ненужные приведения».
И Вы можете щелкнуть правой кнопкой мыши область Обозревателя пакетов, выбрать «Очистить ...» и настроить это с помощью действия «Удалить ненужные приведения».
Так что в принципе это должно быть просто:)