У меня установлено приложение ClickOnce для проверки обновлений после его запуска. Есть ли способ побудить пользователя сказать, что его нет в текущей версии?
Да, здесь есть пример кода: http://msdn.microsoft.com/en-us/library/system.deployment.application.checkforupdatecompletedeventargs.aspx
Вы можете использовать свойство AvailableVersion CheckForUpdateCompletedEventArgs, чтобы узнать новую версию.