Вы можете сделать так, чтобы команды cgi выводили javascript в тексте, а затем включать его вывод, как если бы вы включали любой другой файл javascript.
Пример CGI в Python:
print("Content-Type: text/plain")
print
print("var value = 'Hello World';")
Затем включите это в свою HTML-страницу:
<script type="text/javascript" src="/path/to/cgi/script.py"></script>
<script type="text/javascript"> document.write(value)</script>