Поскольку кажется, что yoy уже попробовал базовые решения, которые документированы в Интернете (phpnature, добавить поддержку php, buildpath и т. Д.), Вероятно, лучше всего просмотреть журналы и указать любую ошибку, которая возникает при попытке вызвать автозаполнение.
Вы можете "привязать" журнал и проверить, появляется ли что-нибудь при запросе автозаполнения (нажмите Ctrl + Пробел после написания "$ this->" внутри метода класса):
tail myWorkspace/.metadata/.log -f
Появляющаяся ошибка может быть полезна для поиска в Google или для включения сюда других, чтобы помочь!