Принятый ответ нуждается в небольшом уточнении. Строка будет там, если CLR включен или отключен. Значение будет 1, если включено, или 0, если отключено.
Я использую этот скрипт для включения на сервере, если опция отключена:
if not exists(
SELECT value
FROM sys.configurations
WHERE name = 'clr enabled'
and value = 1
)
begin
exec sp_configure @configname=clr_enabled, @configvalue=1
reconfigure
end