Перед изменением типа контента
$ iconv -f ISO-8859-1 -t UTF-8 < file.jsp > file-utf8.jsp
У меня это сработало - я на маке.
Если вы Google Arroud, вы найдете несколько сценариев оболочки, чтобы сделать это рекурсивно.
PS. Я не нашел более простой способ сделать это. = /