AFAIK, без использования JavaScript и HTML (4) на данный момент.
Flash может выполнять обработку изображений перед загрузкой - SWFUpload , например, может изменять размер изображений перед загрузкой (хотя и не поддерживает обрезку), но я не знаю реализацию Open Source инструмента обрезки во Flash .
Возможно, это будет возможно и с использованием HTML 5.
Однако я не понимаю, как вам понадобится две загрузки для этого? Разве это не 1. Загрузить 2. Показать с помощью Cropper 3. Отправить информацию об кадре в скрипт PHP, который обрабатывает загруженный файл?