Пока пользователь, которого вы используете для подключения к базе данных, имеет соответствующие привилегии, определенные в MySQL, это не должно быть проблемой.
Для создания баз данных пользователю необходима привилегия CREATE (для удаления их, которая будет привилегией DROP), чтобы создать пользователей, вам нужна привилегия CREATE USER .Вам также может понадобиться привилегия GRANT OPTION , чтобы иметь возможность предоставлять привилегии другим пользователям.
Так что, пока пользователи БД, которые вы можете создать через WHM / cPanel, имеют эти привилегии, вы должны быть в порядке.