Моя ячейка для флажка называется: ToDelete
Код в форме для кнопки:
Private Sub Button_Delete_Checked_Click(ByVal sender As Object, ByVal e As System.EventArgs) Handles Button_Delete_Checked.Click
For Each row As DataGridViewRow In DataGridView1.Rows
If row.Cells("ToDelete").Value Then
MessageBox.Show(row.Cells("SomeText").Value & " will be deleted.")
End If
Next
End Sub

Вот сетка, чтобы дать вамИдея полей и данных, которые я ввел вручную.
Результат нажатия кнопки.
Вам потребуется вставить код вместо удаления вместо кода окна сообщения.Вы можете получить индекс строки с помощью: row.Index.