Изменить исходный код
#ifdef __APPLE__
#include <GLUT/glut.h>
#else
#include <GL/glut.h>
#endif
Не включать GL.h или GLU.h.glut.h должен тянуть их за вас независимо от платформы.
И изменить ваш Makefile
CFLAGS=
LDFLAGS= -framework GLUT -framework OpenGL -framework Cocoa
Обратите внимание, что я также смог создать что-то, используя ваш оригинальный Makefile, но я думаю, потомуУ меня установлен Apple X11.