Sambhaji,
Файлы ISM могут быть двоичными файлами или XML, убедитесь, что вы используете формат XML.
Я не уверен, что опция установлена в InstallShield 11.5, нов InstallShield 12 вы должны перейти к общей информации -> Свойства проекта -> Формат файла проекта.
Я понимаю, что двоичный формат немного быстрее, чем XML, но для того, чтобы мои проекты оставались вконтроль версий Я предпочитаю формат XML.