Если вы хотите удалить файлы при выходе из приложения, я бы рекомендовал вам использовать каталог / tmp. Прочтите документацию по файловой системе .
Также, если вы просто хотите удалить файлы в каталоге документов, сделайте это из applicationWillTerminate следующим образом:
NSArray *homePaths = NSSearchPathForDirectoriesInDomains(NSDocumentDirectory, NSUserDomainMask, YES);
NSString *homeDir = [homePaths objectAtIndex:0];
NSFileManager *fileManager = [NSFileManager defaultManager];
NSError *error=nil;
NSArray *contents = [fileManager contentsOfDirectoryAtPath:homeDir error:nil];
for (NSString *file in contents) {
BOOL success = [fileManager removeItemAtPath:[homeDir stringByAppendingPathComponent:file] error:&error];
if(!success){
NSLog(@"couldn't delete file: %@",error);
}
}