Можете ли вы опубликовать что-нибудь еще о своем домене?
Создание суррогатного ключа для ассоциаций «многие ко многим» вряд ли является хорошим выбором, и может быть более подходящим моделирование предметной области.
Если вас беспокоит производительность, проведите несколько сравнительных тестов с индексами или уникальное ограничение для обоих столбцов FK .
Я почти уверен, что создание суррогатного идентификатора приведет к снижению производительности вставки и не улучшит производительность поиска, поскольку поиск почти всегда основан на обоих столбцах FK.