Вам понадобятся и Application.cfc, и Application.cfm. Переместите весь основной код из Application.cfm в соответствующие части Applicaiton.cfc.
Тогда, и это может быть единственная строка в Applicaiton.cfm:
<cfset variables.dsn = "myDSN" />
Теперь вернитесь в Application.cfc и добавьте это вне всех функций:
<cfinclude template="Application.cfm" />
В вашем test.cfm теперь должна быть возможность вывести переменную dsn без префикса области действия:
<cfoutput>#dsn#</cfoutput>
Если вы определяете variables.dsn где-нибудь внутри CFC, вы помещаете переменную в область действия переменных CFC, которая является частной для CFC. Определив его в CFM, а затем включив CFM, он сохраняется в области переменных запроса страницы.