Конечно, это возможно, но не тривиально.
Хотя было бы проще сохранить копию предварительно назначенной DLL.
Эта цифровая подпись представляет собой нечто большее, чем дополнительный раздел, добавляемый в конец файла PE. Вы можете написать программу, которая удалила подпись, если хотите.
Это не так просто, как усечение файла; Вы должны удалить ссылки на подпись в заголовке файла. Это может осложниться, если в DLL есть несколько подписей, и вы просто хотите удалить одну.
Формат PE-файла публично задокументирован здесь