Я не на 100% в этом, но если вы укажете маршрут в вашем rout.ini как zf-framework / public / Controller / Action и т. Д., Это должно решить вашу проблему.
Я бы посчитал это бандой, но я не уверен на 100% в том, как правильно исправить вашу проблему, за исключением того, что вы изменяете файл vhosts на удаленном сервере, чтобы установить корень документа для общей папки. Если это не вариант, вышеприведенное должно работать, но знайте, что все ваши файлы потенциально доступны для всех (по крайней мере, для вашей структуры папок). Я не уверен, какой вред это может причинить (если таковое имеется), кроме того, если ваша схема базы данных находится в каталоге / data.
Лучше, если это возможно, попытаться получить общедоступный набор в качестве корневого веб-узла.