Компьютер не делает различий между ними - вы должны использовать соответствующие инструкции.
Например, на x86 вы используете JA
(переход, если выше) и JB
(переход, если ниже) для чисел без знака, JG
(переход, если больше) и JL
(переход, если меньше, чем ) для подписанных номеров. Аналогично вы используете IMUL
и IDIV
для умножения / деления чисел со знаком и MUL
и DIV
для чисел без знака.