Не совсем. Единственное, о чем я могу подумать, это то, что JBossAS поставляется со специальными сценариями запуска для соляриса, hp-ux, windows и redhat linux, но этого вряд ли достаточно, чтобы повлиять - не позволяйте этому влиять на ваш выбор ОС.