(setq compile-команда "make")
или аналогичный в вашем .emacs должно быть достаточно.
Для получения дополнительной информации введите
C-h f compile
, который описывает, какие переменные используются при вызове M-x compile.
Там вы должны увидеть, что она вызывает команду компиляции и
C-h v compile-command
говорит вам, что по умолчанию это "make -k". Все вышеперечисленное является упрощением, но вся информация должна быть в этих командах, если вам нужно копать дальше.