Я бы предположил, что это так медленно, потому что iPhone не такой быстрый, как ваш компьютер.
Может быть, посмотрите на другие графические библиотеки, такие как gRaphael . Он основан на Raphael , который используется в Sencha touch , библиотеке JavaScript для мобильных устройств и, возможно, более оптимизирован.