Да, в движке IE9 JavaScript (и в остальном) есть много, много нерешенных проблем. Тем не менее, я бы не стал тратить любое время на их изучение, жду более поздней беты (или RC), в которой (надеюсь) Microsoft исправит некоторые из них.
Это совсем не относится к пользовательскому интерфейсу jQuery, большинство страниц со сложным сканированием JavaScript на данный момент.