Если на сообщение был получен ответ с использованием почтового клиента Microsoft, для него должно быть установлено свойство PidTagInReplyToId с идентификатором ответа на сообщение. Это позволит вам создать цепочку сообщений из каждого ответа на исходное письмо.
В противном случае вам придется полагаться на префикс «Re:» в темах и общих именах субъектов. Вы также можете сделать что-то умное в отношении того, кому было отправлено электронное письмо (в случае общих тем) или использовать предыдущее тело сообщения в новом электронном письме, хотя на это явно нельзя полагаться.