Все,
Я отвечаю на свой вопрос -
на IIS 7 изменение пула приложений работает, но на IIS 6 я не смог заставить работать код, скомпилированный в framework 4.
Я понизил структуру своего приложения до 3.5 (ASP.NET на 2.0.50727).Я пытался в течение двух дней все обходные пути, а затем решил воспользоваться этим путем, чтобы сэкономить время.
На своем сервере приложений я зарегистрировался (ASPNET-REGIIS с опцией -u) asp.net framework 4.0.30319 и зарегистрировался2.0.50727 (ASPNET-REGIIS с параметром -r)
Это решение также было принято в связи с тем, что наш ИТ-отдел не планирует обновлять серверы до 2008 и IIS 7 в ближайшем будущем.
С уважением,
Март