Я предполагал, что будет серверный API, чтобы открывать документ Excel из библиотеки документов, выполнять некоторую обработку и фиксировать этот файл обратно в библиотеку.
Я знаю, что есть веб-службы Excel, но не совсем то, что мне нужно (плюс это только функция Enterprise, мы здесь Стандарт).
Например, как то так? http://blogs.msdn.com/b/ericwhite/archive/2010/03/24/modifying-an-open-xml-document-in-a-sharepoint-document-library.aspx
Я добился большого успеха, используя NPOI для работы с документами Excel.