MVC - это всего лишь шаблон для структурирования вашего кода.
Если вы действительно собираетесь взять свое приложение и перенести его для того, чтобы оно было доступно через Интернет позже, тогда я могу предложить вам закодировать его как приложение WPF с использованием шаблона MVVM, поскольку это потребует меньше работы в долгосрочной перспективе.
В качестве альтернативы, если использовать ASP с самого начала.