Я думаю, что лучшим вариантом для шифрования было бы создать зашифрованный раздел на одном из ваших дисков или, возможно, виртуальный зашифрованный диск, а затем перенести хранилище данных mysql в зашифрованный раздел.Обратите внимание, что вам потребуется ввести пароль при загрузке системы, чтобы смонтировать раздел, но если вы введете его автоматически, безопасность будет бесполезной.В основном это защитит вас от физического вторжения или кражи машины.