Сейчас я не знаю конкретно о jython.jar, но не говорится, что можно даже добавить каждый файл externaljar в проект Android. Вполне может быть, что ваш jar зависит от пакетов, которые не включены в Android SDK (потому что Android не является точным клоном Java, просто упомяну это), и если это так, включить его будет невозможно это.
Попробуйте очень внимательно изучить трассировку стека ошибок и найти что-нибудь, указывающее на наличие недостающих зависимостей. Это может дать вам подсказку, если это относится к вашей банке.