Полагаю, правильная интеграция должна позволять легко связывать коммиты с отслеживаемыми проблемами. Например, это можно сделать, предложив изменениям коммиттера с назначенными ему проблемами. Это единственный пример такой интеграции?
Если вы используете систему с возможностью ветвления (я имею в виду Git, Hg и т. Д.), Вы можете сделать «ветвь на задачу» , которая является довольно мощной, и затем напрямую связать ветку с задачей / проблемой.