Вы можете проверить детей в системном менеджере, чтобы узнать, какой ребенок на вершине. Последний ребенок всегда будет лучшим. Если вы закажете окна заново, коллекция будет обновлена. По крайней мере, так говорит быстрый тест.
var sm:ISystemManager = Application.application.systemManager;
var topChildIndex:int = sm.numChildren - 1;
var topChild:Object = sm.getChildAt(topChildIndex);
// do something with topChild