В окне точек останова (Debug | Windows | Breakpoints) с фокусом выберите все (control-a), удерживая нажатой клавишу Control, щелкните точку останова, которую хотите сохранить (чтобы отменить выбор), и снимите отметку с одной из выбранных точек останова. Все выбранные точки останова будут отключены.